Le célèbre agent Ethan Hunt est cette fois confronté à une intelligence artificielle - l'Entité. Cette dernière pourrait désorganiser les flux d'informations qui transitent massivement autour de la planète, provoquant le chaos.

Pour sauver l'un de ses hommes, Ethan Hunt a laissé tomber du plutonium entre de mauvaises mains: un groupe anarchiste qui veut semer le chaos. Il est alors forcé de collaborer avec la CIA pour retrouver ce plutonium avant qu'il ne soit trop tard.

La CIA obtient la dissolution de la peu orthodoxe équipe de Mission Impossible. Ethan Hunt se retrouve donc en situation difficile, alors même qu'il lutte contre le Syndicat, un organisme qui veut établir un nouvel ordre mondial grâce au terrorisme.

Un tireur embusqué dans une ville américaine fait un carton sur des passants pris au hasard. La police arrête un suspect, un soldat trahi par ses empreintes digitales. Le condamné demande à voir un certain Jack Reacher.