Itto, tueur à gages, a une nouvelle mission : tuer un prêtre détenteur de secrets compromettants. Itto doit l'empêcher de remettre au Shogun les preuves qu'un seigneur manigance pour transmettre son héritage à sa fille illégitime.

Ogami Itto occupe un poste très convoité au Japon: il est le seul à pouvoir décapiter des seigneurs au nom du Shogun. Le clan Yagyu, jaloux, le fait accuser injustement grâce à de fausses preuves, afin de provoquer sa destitution.

Quelques jours après la fin de la seconde guerre mondiale, un régiment japonais erre dans la jungle en Birmanie. L'un des soldats est Mizushima, éclaireur et joueur de harpe. Ces Japonais se font encercler par l'armée britannique.